半相合移植成功有兩個重要關鍵，一是減輕移植失敗（graft failure）的風險，二是降低移植物抗宿主疾病（graft versus host disease, GvHD）的程度。根據此二點，台大癌醫造血幹細胞移植團隊有兩項創新：

A.減輕移植失敗（graft failure）的風險：

對於所有非相合移植患者全面檢測抗捐贈者HLA的特異性抗體（donor HLA-specific antibody，DSA），並根據測驗數值導入DSA階段性減敏療法（DSA desensitization protocol），以大幅降低移植失敗的機率。
移植失敗（graft failure）是半相合移植面臨最嚴重的併發症之一。有許多危險因子會導致這項最嚴重的併發症，包括本身疾病狀態、HLA不合程度使用之調節療法移植幹細胞數量以及抗捐贈者HLA的特異性抗體（donorHLA-specific antibody，DSA）。一般異體幹細胞移植發生移植失敗的機會很低（低於5%），但是在半相合移植機會會上升至10%以上，特別若是使用調節處方為Post- transplant cyclophosphamide, 簡稱PTCy）發生率可以會上升至13%。移植失敗一旦發生，若沒有成功找到下一個捐贈者，死亡率逼近100%。
根據過去文獻顯示，DSA是幹細胞移植失敗一項獨立因子，不論幹細胞來源為何6。移植前DSA陽性（平均螢光強度Mean Fluorescence Intensity, MFI>1500）則發生移植移植失敗的機率高達75%，但若DSA陰性則發生移植失敗的機會只有5%。而DSA數值的高低，也決定它影響移植失敗的機率，研究顯示DSA的MFI超過10000、MFI介於2000到10000與MFI小於2000三個族群，發生原發性移植失敗的比例分別為60%, 31.6%與3.2%，而造成移植相關死亡率為33.3%, 14.7%與17.2%，整體存活率為44.4%、85.3%與77.3%。
故若採取HLA不相合捐贈者作為幹細胞來源，皆應檢測受贈者體內是否帶有DSA，並根據其DSA的MFI數值高低決定是否使用減敏治療處方（desensitization protocol）。步驟如下：

兩階段DSA檢測方法：群組反應性抗體監測（Flow Panel Reactive Antibody, PRA）及單一抗原抗體檢測（HLA single antigen detection）。
針對DSA陽性的受贈者，根據MFI值的高低，在移植調理處方前給予DSA減敏計畫（DSA desensitization protocol）。
台大癌醫幹細胞團隊也為此設計了本院自己的DSA流程表：針對HLA不相合捐贈者檢測DSA，DSA陽性者MFI小於2000不需要特別處理，MFI大於10000會考慮更換其他捐者，而MFI介於2000到10000需使用減敏療法。減敏療法包括三個部分（修改自MDACC的DSA減敏療法）：

D-15, D-13, D-11使用雙重血漿過濾術（double filgrationplasapheresis, DFPP）或血漿置換。
D-10, D-9給予1m/kg IVIg。
D-8給予一劑Rituximab 375mg/m2。

B.降低移植物抗宿主疾病（graft versus host disease, GvHD）的程度

為降低移植物抗宿主疾病（graft versus host disease, GvHD）的發生率與程度，使用不同方式之移植調理處方及抗排斥處方來降低急性與慢性排斥反應。臺大醫院採取兩種半相合之移植調理處方：一種由2006中國大陸學者Dao-Pei Lu提出使用骨髓幹細胞與周邊血幹細胞作為來源，使用抗胸腺球蛋白（antithymocyte globulin; ATG）為主的抗排斥藥物，稱之為GIAC protocol11。另一種則是2001年巴爾的摩（Baltimore）學者提出之移植後cyclophosphadmide（post-transplant cyclophosphamide, PTCy）12。近年來以合併ATG與PTCy為主的抗排斥療法逐漸成形，甚至已從非相合捐贈者應用至全合捐贈者。